יצחק גלפט נולד בנובואוקראינקה, אוקראינה בשנת 1900 ועלה לארץ ישראל בשנת 1922. למד לתואר שני במכון למדעים בינלאומיים בג'נבה ולדוקטורט בכלכלה באוניברסיטת בריסל, שבה קיבל תואר דוקטור בשנת 1931.

לאחר מכן חזר ארצה וייסד את העיתון הכלכלי הראשון בארץ, המשק השיתופי, שאותו ערך. בשנים 1959-1936 גלפט היה חבר סגל בכיר בבית הספר הגבוה למשפט וכלכלה בתל אביב. בשנים 1949-1948 שימש נציג כלכלי של מדינת ישראל במדינות סקנדינביה, ובשנים 1953-1949 ניהל את מחלקת המחקר הכלכלי במשרד האוצר. בשנת 1962 הצטרף לסגל המחלקה לכלכלה באוניברסיטה העברית.

תחומי מחקרו העיקריים היו קואופרציה וכלכלה שיתופית; מחשבה כלכלית סוציאליסטית; המשק הערבי בארץ ישראל המנדטורית ובארצות המזרח התיכון.

יצחק גלפט נפטר בירושלים בשנת 1977.